Après quelques précisions sur les caractéristiques générales de la vie en estuaire ainsi que l'évolution historique de l'estuaire de la Seine, ce fascicule traite de l'état des connaissances actuelles sur l'estuaire, de l'organisation des chaines alimentaires et enfin du fonctionnement actuel de l'écosystème. ©Electre 2025

L'estuaire de la Seine a été fortement aménagé aboutissant à une réduction de la zone intertidale à moins de 30 km², à une chenalisation du fleuve de Poses à la mer et à une forte compartimentalisation de l'édifice biologique qui est diversifié en habitats mais pauvre en espèces. Il existe des contrastes entre des zones où la faune est très abondante (vasière intertidale nord ; plancton de la partie salée de l'estuaire) et des zones presque azoïques (benthos de l'estuaire fluvial). Il existe, d'une part, des paradoxes entre l'extrême abondance des premiers maillons de la chaîne trophique et le fait que ceux-ci soient soumis à des apports en contaminants et, d'autre part, entre l'abondance des proies disponibles et la pauvreté de l'ichtyofaune. L'estuaire aval reste un lieu de nourrissage important pour les juvéniles de poissons marins et les oiseaux, notamment les limicoles. La gestion globale de l'estuaire impose des mesures permettant le maintien de la fonctionnalité actuelle de cet estuaire d'intérêt européen pour les oiseaux et assurant la restauration des grands poissons migrateurs.

In the Seine estuary, intertidal mudflats have been greatly reduced (< 30 km²) following channel management of the Seine river from Poses, in the upper part, to the sea. There are great differences between the biological compartments, ranging from areas with very high abundance of organisms (benthos on the muddy intertidal zone and, zooplankton in the lower part of the estuary) to areas with very low abundance (macrobenthos in the Seine river). There is also a contrast between the high abundance at the first levels of the trophic chain in a contaminated environment and the low abundance of fish. However, on the European scale, abundance in the Seine estuary remains high for young fish and birds, especially waders. In the future, global management of the estuary will be required to ensure the biological compartments current level of functioning and to propose measures for rehabilitation of migrating fish.